(Automatisk oversat) 20 år er gået, siden verdensledere tilbød en ubetinget overgivelse til fremmede styrker og XCOM, planetens sidste forsvarslinje, blev efterladt desimeret og spredt. Nu styrer udlændinge Jorden og bygger skinnende byer, der lover en strålende fremtid for menneskeheden på overfladen, mens de skjuler en uhyggelig dagsorden nedenfor og eliminerer alle, der adskiller sig fra deres nye orden. Kun dem, der bor i udkanten af verden, har en frihedsmargin. Her samles en styrke igen for at stå op for menneskeheden. Altid på flugt skal de resterende XCOM-styrker finde en måde at rejse sig fra asken, afsløre den lumske sandhed bag besættelsen og fjerne den fremmede trussel en gang for alle.
