(Automatisk oversat) Tyve år er gået, siden verdens ledere tilbød en ubetinget overgivelse til fremmede styrker, og XCOM, planetens sidste forsvarslinje, blev efterladt decimeret og spredt. Nu regerer rumvæsnerne Jorden og bygger skinnende byer, der lover en strålende fremtid for menneskeheden på overfladen, mens de skjuler en uhyggelig dagsorden nedenfor og eliminerer alle, der tager afstand fra deres nye orden. Kun dem, der bor ved verdens kanter, har en frihedsmargin. Her samles en kraft endnu en gang for at stå op for menneskeheden. Altid på flugt skal de resterende XCOM-styrker finde en måde at rejse sig fra asken, afsløre den lumske sandhed bag besættelsen og eliminere den fremmede trussel én gang for alle.
